kesehatan

Kematian mendadak pohon oak: Urutan genom dari agen fitopatogenik

kesehatan Kematian mendadak pohon oak: Urutan genom dari agen fitopatogenik

SCP-093 Red Sea Object | Euclid class | portal / extradimensional / artifact / stone scp (Mungkin 2019).

Anonim

Sebuah tim peneliti Amerika, yang dipimpin oleh Brett Tyler dari Institut Bioinformatika Virginia, dan Dan Rokhsar dari Institut Genom Gabungan di California, baru saja mengurutkan genom jamur patogen Phytophthora ramorum, menghidupkan kembali harapan akan pertarungan biologis melawan parasit ini.

Pengaruh parasit pada kulit pohon
Kredit: Berkeley Lab.

Penyakit kematian mendadak dari pohon ek adalah phytopathology yang baru-baru ini diamati, sejak kasus pertama yang tercatat berasal dari tahun 1995 di California. Hal ini disebabkan oleh P. ramorum, mikro-organisme keluarga Oomycota. Spesies ini dapat membuat parasit lebih dari 40 spesies tanaman, termasuk Fagaceae (ek, chestnut, beeches) dan banyak tumbuhan runjung. Parasit menyerang pohon oleh kulit kayu, dan memotong sirkulasi getah yang diuraikan. Akar membusuk, akhirnya menyebabkan kematian pohon karena kekurangan air.

$config[ads_text] not found

Diseminasi sangat cepat: parasit menyebar melalui udara dan air, dengan cepat menyebarkan infeksi. Epidemi sejati membentang lebih dari 400 km di sepanjang pantai California, dan telah berkembang sejak Agustus 2001 di Oregon. Kerusakannya signifikan: untuk satu-satunya cemara Douglas, spesies populer orang Amerika sebagai pohon Natal, taruhan ekonomi mencapai hampir satu miliar dolar. Selain itu, kulit kayu merah, digunakan secara ekstensif dalam berkebun, dapat mencemari tanaman pembibitan seperti rhododendron dan camelia. Jika di Australia, epidemi dapat dihentikan oleh pembuangan pestisida udara, solusi seperti itu sulit untuk dibayangkan di negara bagian AS yang padat penduduk ini.

Para peneliti AS mempresentasikan pekerjaan mereka pada Kamis, 10 Juni, di Institut Genom Gabungan, mengungkapkan genom dari 65 juta pasangan basa termasuk sekitar 15.000 gen. Tim peneliti berharap bahwa peta genom P. ramorum akan mengidentifikasi gen yang mengkodekan protein kunci parasit, yang kemudian akan memungkinkan pengembangan tes skrining dan perawatan. Saat ini tidak ada cara untuk mendeteksi keberadaan parasit sebelum pohon menunjukkan gejala yang terlihat yang muncul lebih dari setahun setelah sakontaminasi.

Everist Hansen, Phytopathologist di Corvallis University, Oregon, telah dengan campuran menyambut hasil ini: "Ini adalah berita baik, " katanya, "tetapi sementara ini adalah hasil penting untuk mengaitkan penelitian, ini tidak akan menyebabkan hilangnya cepat ancaman lingkungan ini. " Sementara Matteo Garbelotto, seorang ahli fitokologi di University of California, telah memilih strain P. ramorum yang diurutkan untuk pekerjaannya, dia tidak membayangkan pengembangan alat skrining yang dapat diandalkan selama satu tahun, dan tidak ada perawatan sebelum satu dekade. tahun penelitian.

Pesan Populer